マギサ最終かガンダゴウザ最終か

どちらもLv100まで上げています。
どちらにも強みはあるので、最終しなかったほうも余力がでたら最終したほうがいいと思います。

で、どちらが使う場面が多いか、後々まで使うかといったら、圧倒的にマギサだと思います。
ランク178になった今でも、マウントが欲しい敵のときには編成して使っています。
反対にガンダゴウザを使う場面はあまりありません。
（１アビの上位暗闇が効果高いので、ナタクなどはまるとことはあります。また拳パーティにすると強いらしいです。）

じゃあマギサが火力があるかというと、Lv90以上にあげて、4アビで魔神モラクスを召喚できれば強いです。
モラクス召喚すると、攻撃力1.3倍、常時DAなど火力がすごく底上げされます。
ただし、モラクス召喚するとHPがずるずると減っていきます。
これは、高ランクでHPが高くなるとあまり気にならないし、武器としてオールド・エッケザックス（オッケ）をたくさん編成して背水で戦るとむしろメリットになります。
しかしランクが低く武器が整ってなくてHPが低い状態だとただひたすらもろいだけになります。
なので、初心者の方が「火力がでるでしょうか」という場合では、一概にYESとは言えないところがあります。
（「安定して戦えるでしょうか」「後々まで使えるでしょうか」でしたらYESです。）

ガンダゴウザは、古今無双の大拳豪というから火力がすごい・・・かと思ったら、実はそうじゃなかったりします＾＾；
実装したてのころは「産廃」と呼ばれるほど弱く、何度かのアップデートを経て今に至っています（なので昔の攻略記事だと非常に弱いと書かれてたりしますが今はそうではありません。）
古今無双Lvというのがあって、攻撃を当てるごとに最大Lv10まで上がります。古今無双Lv10の状態で奥義を打つと強いです。
Lv90で1アビにダメが追加、Lv100で2アビに奥義即発動＋古今無双Lv10が追加になるので、Lv100まで上げるのなら、短期戦ではガンダゴウザのほうが火力が出ると思います。
3アビでPT全体の火属性攻撃とDAアップ、サポアビで格闘キャラのDAアップがありますので、格闘PTにするときは強いと思われます（私はしたことがありません。）

なので、「火力がでるか」という答えにはどちらも条件付き、総合的に見てマギサをお勧めします。

　状況によりけりなので一概には言えませんが、マギサを優先するメリットを挙げるならば、

・最終後Lv100で1アビで敵の攻防25％ダウン付与、ミスト互換なので主人公のミストが外せる（但し成功率が90％でLBには弱体成功率アップがないので指輪などによる補完は必要）
・モラクス召喚で自身の火力30％アップ防御100％アップ、必ずDA発動
・モラクス召喚による自傷効果で背水環境との相性○
・モラクス帰還時に敵に最大140万程度のダメージ
・2アビでマウント付与、3ターンの間味方攻防20％アップ
・3アビで敵に灼熱効果付与（今度開催のブレイブグラウンドで活躍）

となかなか使い勝手の良いアビが揃ってます。自身の火力と言うよりかＰＴ全体補強といった感じですね。まぁ、バッファーデバッファーとしては中途半端感はありますがヴィーラと一緒でマウントが腐らないのがいいですね。

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マギサです。
どちらも最終済み、マギサはメインでガンダゴウザは
サブで使用してます。余力あればどちらも最終しましょう。

どちらもレベル100にしたので参考までに。
現段階では得意武器毎の編成とかを考える時期では無いと思いますが火属性の格闘パが強いのでガンダゴウザはおススメです。

他の方も言っているようにキャラ毎の役割が違う。マギサパデバフ、マウント。ガンダゴウザは火属性攻撃アップ、連撃アップ。

手持ちにシヴァがいるなら、火属性攻撃アップが更にブーストされるのでガンダゴウザもおススメ。
単純に連撃アップと火属性攻撃アップだけ考えてもおススメです。
もちろん、他のキャラや主人公でその辺をカバー出来るならマギサでも良いと思います。

ガンダゴウザ→奥義沢山打って自分の火力盛り盛りにする

マギサ→デバフやらバフやら色々器用にこなして、デメリットつきだけど自分の火力も盛れる

かなりざっくりした説明だとこんな感じです。
ただ初心者の場合、キャラのレベルを100にするのって結構時間かかるので、レベリングの途中で上限解放の素材集まりそうですね。

あと序盤は奥義が火力のメインかと思うのでガンダゴウザの方が直接的な戦力アップに繋がりそうです。

長期的にみたらマギサの方が有用。結局敵によってキャラは変えていく方がいいのでどっちが先って話ですので。