4凸を見据えたマグナ武器やイベント武器のエレメント化について

○旧マグナ武器
火：コロ杖
水：うなたん
風：ティア銃
土：ユグ剣（ユグ杖）
光：シュヴァ剣（シュヴァ銃）
闇：セレ爪（セレ斧）

○マグナⅡ武器
火：シヴァ剣
水：ロペ琴
土：ブロ刀、ブロ斧
風：ベイブレード
光：メタ弓、メタ短剣
闇：アバ杖（アバ銃）

マグナでメイン収集するものと言えば大体この辺り。
人によってはシヴァ拳とかロペ杖とかも収集して4凸されています。
メインとしてならグリム武器はどれも優秀だったり、奥義上限目当てにブロ短剣も作られたりしてます。

で、見てもらえれば分かりますけど、武器エレって英雄武器とかオメガ武器とかのエレメントが上乗せされるので、それらを作成する武器種や解放の必要が多い武器種は少し意識しておく必要がある程度であってどれもある程度は必要になるんですよね。
ただ、どれもネックになるのは武器エレよりも属性エレの方なので、正直意識する必要もないですよ。
餌兼エレ用みたいなストック作っておけば済む話です。

他のかたがあらかた回答されてるので、少し違う視点でお話しますが、
十天衆最終で40箱コースを洗濯した場合、
1本砕く当たり武器エレ80が手に入るので、かなり増えますよ。
質問者さんのランク等の記載がないので十天最終が視野に入るようでしたらご認識ください。

あとは、サイドストーリーのクリア報酬が3凸スキルレベル1なので私はそれは砕きました。

現状の武器エレ集まり具合によるとしか言えません。
例えば、ガチャ武器はリミ武器だけでなく全部
とっておきたい人なのかどうか。
課金勢か無課金勢かサプチケのみ課金か。
人によりプレイスタイルにより変わります。

で、仰る通り短剣や拳エレも大事なんです。
うな短剣やセレ爪を4凸するのに使いますからね。
でも何故みんなあまりそう言わないか？
答えは簡単です。
水、闇は一応神石移行があるからです。

リヴァ短剣はヴァルナ編成ならあまりいらない、
セレ爪もハデス移行視野に入れたら1〜2くらいでok。
そう考えると、誰にでも需要ある武器エレではない。
ティア銃やゴブロ刀程絶対ではないのが短剣、拳なのです。

なので、全属性マグナで行く気持ちが硬い方であれば
短剣エレ、拳エレも他エレ同様重視しましょう。
ケルフェン開催次第、ヴァルナ引けたら神石行くかも、
って方なら倉庫に一旦しまい、神石移行前にマグナが
4凸できるならその都度不足分エレ化、くらいがちょうどいいかと。餌にもエレにもできる状態にしておくのが
安心ですね。

ある程度ガチャをしていれば、武器エレメントに困ることはあまりないように思います。
私の場合、ガチャSR武器はほとんど出た瞬間砕いています。
（使っていないけど闇ルシウス武器だけ保存してます。）
また守護のSSR武器も砕いています。

それで武器エレメントに困ったのは、私の場合、リヴァ短剣を４凸したときだけです。
短剣ってあんまないんですよ。
もちろん人によっては何本もキャサリンやシャノワールの解放武器が出てしまっていて困らないって人もいるかもしれませんが・・・。
そのときだけ、ゆぐゆぐ回ってユグ短剣拾っては砕く作業をしました。

それ以外は、各属性マグナ4凸（ほぼ終わっています）と、黒猫・グローリー取得用のJMB、ソーンとサラーサの最終で武器エレメント困りませんでした。
次に最終する予定のオクトー用の刀エレメントも不足していません。

今後、たとえば黒猫のJMBを各属性でほしいとか、さらに十天を解放していくとすれば困ることもあるかもしれません。

つまり次やその次作るもののエレメント数見て、足りなそうなら残しておくのでいいのではないでしょうか。
たとえば、「次はカトルを取得して最終したい」というのなら、短剣エレメント足りなくなりそうだからユグ短剣や、3凸終わっていればリヴァ短剣を残しておくか砕いてエレメントにしておけばいいと思います。
たとえば剣豪やりたいからJMBを各属性で作りたいというのなら、コロ刀を残しておきましょう。

自分の予定次第です。