召喚石の扱い方について

バハ：
バハを二枚4凸出来るだけ金剛をバハに回せるの？
これが回答
正直ルシと違って複数欲しい場面が思い当たらないので凸推奨（自分も被って即凸した）

高級鞄：
凸分集まるまで保留でもいい、けど同上
高級鞄は最悪サプがある

SR鞄：
効果時間3T、リキャスト8T、要するに3枚あれば常時鞄を使っていけるのでそれ以上はほぼ不要
殆どの場合、使っても2枚だが常時カットを入れたいという特殊なケースでの使用が一応ある
（高難易度クエストをソロやってるような人たち御用達）

個人的に重ねるか悩むのはルシとシヴァぐらい。

バハムート
１つ４凸があると全属性で入りますが２つ目入る余地があるというと無いことの方が多いです
個人的には重ねて金剛使用数減らしていいものだと思います

ギルガメッシュ
典型的な３凸ないし４凸がとてつもなく強い石です
よって重ねましょう

各種カーバンクル
２つ持っているとダメカを結構なターン数キープできるという利点があります
特に闇は長い間つよばはで２つほしいと言われていた時期がありました
現在だとそこまで必要とされるマルチがあるかといえば無いです

他に複数持ちしたい石はシヴァです。召喚効果があまりにも強いので枚数のほうが大事になります
アテナも２枚あったらあったで保険になることがあります。多分アルバハHLだけですが
ルシフェル４凸は２枚あったら強いんでしょうけどまず金剛を回しきれません

＞バハムート、ギルガメッシュがそれぞれ2個あるのですがこれらは上限解放に使うべきか2個持ちするべきか？

とりあえずわからないうちは上限解放しないほうがいいです。
召喚に限らず武器も全て同じ回答になります。

＞カーバンクル系は複数持ってるといいみたいなのを見た気がするので保管してるのですがいい加減増えすぎて困ってるので何個ぐらい持ってるのがいいのか？

２以上編成することはほぼないですし、編成しない場合もあります。
こちらも上記同様わからないときは上限解放しないほうがいいです。
SR召喚石は簡単に凸できる方法が別にあるので、よくわからないうちは保護しておくといいです。

総じてですが、一度に理解しきれるほど簡単な仕組みではないので、迷ったら上限解放せず保護もしくは倉庫がオススメです。