グランブルーファンタジーの回答詳細

ある程度ガチャをしていれば、武器エレメントに困ることはあまりないように思います。
私の場合、ガチャSR武器はほとんど出た瞬間砕いています。
（使っていないけど闇ルシウス武器だけ保存してます。）
また守護のSSR武器も砕いています。

それで武器エレメントに困ったのは、私の場合、リヴァ短剣を４凸したときだけです。
短剣ってあんまないんですよ。
もちろん人によっては何本もキャサリンやシャノワールの解放武器が出てしまっていて困らないって人もいるかもしれませんが・・・。
そのときだけ、ゆぐゆぐ回ってユグ短剣拾っては砕く作業をしました。

それ以外は、各属性マグナ4凸（ほぼ終わっています）と、黒猫・グローリー取得用のJMB、ソーンとサラーサの最終で武器エレメント困りませんでした。
次に最終する予定のオクトー用の刀エレメントも不足していません。

今後、たとえば黒猫のJMBを各属性でほしいとか、さらに十天を解放していくとすれば困ることもあるかもしれません。

つまり次やその次作るもののエレメント数見て、足りなそうなら残しておくのでいいのではないでしょうか。
たとえば、「次はカトルを取得して最終したい」というのなら、短剣エレメント足りなくなりそうだからユグ短剣や、3凸終わっていればリヴァ短剣を残しておくか砕いてエレメントにしておけばいいと思います。
たとえば剣豪やりたいからJMBを各属性で作りたいというのなら、コロ刀を残しておきましょう。

自分の予定次第です。