バハ武器について

〇種族が3種類以上ある場合
1人バハ武器が乗らなくても仕方ない、と割り切りましょう。（ちなみに、キャラが揃えば３種にしなければならない場合というのはほぼ無くなると思います）

〇バハ武器を抜く場合
マグナ編成であれば、バハ武器がのらない1体のためにわざわざ抜く必要はないです

〇バハ武器がない編成をよく見る
神石編成のことだと思いますので、そちらの話を。神石編成ですと通常攻刃の恩恵が下がるためバハ武器をぬいた方が強いためになります。

バハ武器は種族不明、星晶獣にはどの武器種関わらず効果が乗るので、ヒューマン、ドラフ、エルーン、ハーヴィンの内、主人公除き各1人ずつの編成の話でしょうか？

メインアタッカーと主人公に効果が乗ればそれなりに効果はありますし、支援役や防御役には加護が乗らなくても編成してます。

マグナ編成の場合３人乗れば十分強いです

強い人に入ってないというのは多分神石編成で
神石だとバハ武器は弱いので入らなくなります

○多種族でのバハ武器に関して
バハ武器は多くの編成で使いまわせる利点があるので武器編成が纏まらない内は入れておいてよいかと。
因みに、ノヴムまでで3種族なら主人公+αで2人にスキル効果かかるので、全体で見た時には大体半分ぐらいのスキル効果と思っておくと良いかと思います。
（バハ短剣だとSLv最大で30%、その半分でだいたい15%（普通の攻刃大）ぐらい）

○バハ武器が編成されていないもの
おそらく神石（アグニスとかハデスとか）編成の事だと思われますが、マグナ編成を目指す段階であればマグナ編成にはほぼバハ武器が編成されるので現状気にする必要はありません。