最終的に闇編成を強くするにはマグナなのか？神石なのか？

とりあえずマグナ神石関わらず麒麟剣弓は優秀ですので是非
あとマグナにフォールン単品はいらないと思いますので終末なりオメガなり最悪爪もう一個に変えることをオススメします

んで神石どうするかですが
グラシにしろフォールンにしろアバ杖揃えた段階まで進んだマグナを超えるには3-4本は武器が必要です(闇マグナって実はそんなに弱くないんです)
そっから終末5凸だウンハイルだマジェだetc...とやってやっとマグナを叩き潰せます
そして根本的な話としてそこまでダマ(あるいはリアルマネー)突っ込む覚悟があるかい?という話になります
覚悟があるならグラシサプりつつ各種リミ武器引きつつ終末も...とやっていくのがいいのではないかと
理想編成等は探せばいくらでも出ると思うので割愛します

闇編成でどこまでやりたいのか次第じゃないでしょうか。

各属性に対して有利属性しかあてないのであれば、
アバター杖+セレ拳で、
闇ゾーイをデスで落とせば初速は十分です。
HPも杖2本と終末オメガ等でそこそこ確保出来ます。

火力面だけでいえば、
差を体感する為にはフォールン3～4は欲しいですし、
かといって集めやすいグラシ染めでは、
結果背水してるので手間変わらず、
使用リソースに対して得られる効果が見合ってないです。

まずはアバター杖4凸2本確保して、
デスラーとか試してから再考でもいいのかなと思います。

ハデスがマグナと差別化できるのは大きく分けて、以下の2つではないでしょうか？

1、渾身編成ができる。
水ゾをパーティから外すことができるのでパーティに幅を持たせられる。コンジャクションの演出を見なくて良いのは特に短期戦では大きいメリット。
しかし背水編成もけして弱くはなく、水ゾさえあれば気軽に上限を叩き出せ、コルルも追加された為、渾身が一強ではない状況。

2、マジェスタ(マリス杖)で背水管理、高難度バトルが楽に。
マグナ編成でも背水は可能ですが、やはりマジェスタ(スキル堅守中)を入れることでかなりパーティが安定するところが差別化できる点です。ルシファーhlとかでも無理は禁物ですがファラ無しでも通常攻撃を受けられるぐらい硬くなります。これから追加される予定のソロバトルでどの様な難度になるかわかりませんが、この杖4凸2本ぐらいあればかなり安定した攻略ができるはずです。

背水にしろ渾身にしろ、ハデス編成に移行するためにはグラシやフォールンの4凸が複数揃えられないとセレ拳4凸5本のマグナと差別化できた感じがしないと思います。またハデスに移行するにしろアバ杖4凸1本はあったほうが良いと思います。

想定している使い道やダマスカスの数等がわからないので、現状の編成にアバ杖を追加するのが良いのではないでしょうか？