どっちを優先すべきか

仮に水マグナの4凸で計算してみましょう。このサイト参照の水マグナ編成ではリヴァ短剣×5となってるのでそれを基準にします。

武器を4凸させた場合→1本毎に攻刃+3%で5本4凸で攻刃+15%です。キツい素材は水エレ×1000、短剣×1000。

召喚石を4凸させた場合→片面で攻刃+15%です(SLv10を5本だと攻刃値75となりそこから3凸時と4凸時の加護効果の差分の値です)。キツい素材はロペアニマぐらいです。

とまぁざっくりした計算ですがどちらを先にするかは一目瞭然かと思われます。また片面ならフレンドで拾える(今月のアプデ？でフレンド数回使い続けられるようにするみたいなこと書いてたので尚更)可能性もあるのでそちらも一応加味しましょう。

火→期待は出来ない。大体シヴァでちょろっとアグニス、マグナ4凸はほぼ拾えないです

水→ほぼ拾えません。大体120石とヴァルナ、マグナ4凸はまぁ希少種です。

土→そこそこ拾える。ゴブロかマグナ4凸か半々か6:4ぐらいといった所。不安定

風→ほぼ確実に拾える。マグナ4凸が切れる事はほぼなく安定して拾える。

光→不安定。ルシフェル祭りなので過度な期待出来ませんが拾えない事もないです。

闇→まぁまぁ拾える。バハムートが多いですがマグナもそこそこいるので拾えない事もないです。

個人的な所感ですがこんな感じなので上記両方を加味するなら火、水はマグナで行くなら最優先してもいいです。逆に風は片面なら拾い続ける事も可能なので属性石があれば武器を先に4凸させてもいいです。他はまぁ自身のフレンド枠次第です。

石の4凸の方が恩恵が大きいと思います。

ただマグナ武器4凸ぐらいの戦力がないとマグナ2でなかなか青箱が取れず、効率が悪くなるかもしれません。

その場合はなにか1属性の武器を育てながら、その属性を使ってマグナ2を攻略してみてはいかがでしょうか？

石4凸優先で良いと思います。
石のほうが恩恵が大きいので。