リミットボーナスについて

主人公同様に基本は攻撃力やDA率アップに振っておけば間違いないでしょう。
最もキャラそれぞれで内容が違いますので、あくまでもとりあえず振って問題ないステはその辺でしょう。
一例を上げるなら壁キャラならHPや防御力を優先するのもアリかと。

グラブルエンジョイ勢は堅苦しく考えず振っとけば強くなるくらいの認識でいいと思います

ただ具体例を挙げるとしたら
変態的火力なんてねえよ！という大多数のプレイヤーは、攻撃力UP防御力UP（強化を実感しやすい）
通常攻撃が減衰値に届きやすいとお悩みの上級者は、DATA確率UP（実質火力大幅UPにつながりやすい）
どこでも同じ属性で出掛ける人は、クリティカルや○属性軽減以外（有利以外意味なし）
HLを意識した編成や水着ゾーイ背水パは、HP（生存力、背水効果UP）
といった感じになります

例えばオーキス
この子のLBに防御UP×3、HP×2、敵対心DOWNがあります。これらを取るとオーダーマリオネット維持型長期戦ゴリラになります
一方、攻撃UP×2、闇属性攻撃、奥義ダメ、対OD攻撃という短期戦向きのワンパンゴリラ構成もできます
といった感じに、キャラの性質を理解している前提でのLB構成になっていますので
LBを最大限に活用したい人は、よく行くクエストや自分の装備パーティ構成によって振るべきLBが異なることを念頭に置いてください

闇ジャンヌはまだ実装されていないので答えかねますが、基本的にはHPや攻撃、DA確率アップなどでしょうか。攻撃などは全て解放するとキャラによっては＋5000まで上がったりします。
また、そのキャラの性能をサポートするものがあり、例えばリミテッドオーキスだと敵対心DOWNを付けることができ、オーキスの弱点をかなり補うことができます。
なんであれキャラの性能に直接影響があり、確実に強くできるものを優先するのが良いと思います。